Ich benutze den MCPatcher, habe sogar noch eine Beta 1.5 .jar rumliegen. 
Also auch für Backups ist er zu empfehlen. 
Wenn Ihr den Server updatet, müsst ihr auf eine Sache achten: Ihr müsstet den Warenschmuggel durch Endertruhen
zwischen Jobfarm und Hauptserver sowie PvP und Hauptserver irgendwie
verhindern. (Obwohl der ziemlich schwer sein wird. PvP ist sowieso
komplett gesichert und in der JF kommt man schwer an Enderaugen.)
PS: Es gab keinen "Bearbeiten"-Button, nur deswegen habe ich einen 2. Post geschrieben.
(Hab ich gemacht O.-) Ares